L'amphidromie est le modèle migratoire prédominant des espèces indigènes des Antilles, il est également représenté chez certaines espèces des hydrosystèmes guyanais. L'amphidromie est un type de migration diadrome (entre la mer et l'eau douce) qui s'effectue des rivières vers la mer et de la mer vers les rivières. Les particularités des espèces amphidromes sont : (1) la nécessité d'accomplir une migration de dévalaison après l'éclosion ; (2) la dispersion larvaire marine ; (3) la migration de montaison au stade juvénile. La réalisation complète de ce processus migratoire est primordiale pour le maintien des populations dans les cours d'eau. Or, aux Antilles, les cours d'eau sont le lieu de pressions anthropiques importantes, notamment pour le prélèvement de la ressource en eau et la production de l'énergie hydroélectrique. En Guyane, les cours d'eau sont actuellement peu aménagés mais des projets de développement de l'hydroélectricité sont engagés et cette pression se rajoute à celles induites par l'orpaillage notamment. Tous ces aménagements et modifications physico-chimiques constituent des ruptures de la continuité écologique qui interfèrent directement avec le bon déroulement des migrations des espèces de poissons et macrocrustacés amphidromes, principales espèces aquatiques de ces régions. Certains traits de vie de ces espèces demeurant méconnus, l'acquisition de connaissances est essentielle pour mettre en oeuvre des mesures de gestion adaptées aux spécificités de ces espèces et aux besoins croissants des populations humaines. Plusieurs missions de terrain ont été organisées aux Antilles et en Guyane. Ce rapport présente les résultats sur la fréquentation des habitats, la typologie spatio-temporelle et la structure démographique des peuplements sur la rivière de Beaugendre en Guadeloupe. Grâce à l'analyse élémentaire des otolithes des échantillons pêchés aux Antilles, l'amphidromie est validée chez le mulet de montagne Agonostomus monticola (Bancroft 1834), le poisson tétard Arcos nudus (Linnaeus 1758), le petit dormeur Eleotris perniger (Cope 1871) et chez trois Gobiidae : le jolpot Awaous banana (Valenciennes 1837), le gobie à joue tachée Ctenogobius fasciatus Gill 1858 et le colle-roche Sicydium plumieri (Bloch 1786). Concernant les échantillons pêchés en Guyane, l'amphidromie est validée chez deux Eleotridae Eleotris spp. et chez deux Gobiidae, le gobie lyre Evorthodus lyricus (Girard 1858) et Awaous flavus (Valenciennes 1837). Chez Arcos nudus (Guadeloupe), les analyses microchimiques peuvent également être interprétées comme un profil semi-amphidrome ; et chez Eleotris sp1 (Guyane), le profil amphidrome semble facultatif pour les individus vivant en mileu saumâtre. La durée de phase larvaire est déterminée chez Agonostomus monticola, Awaous flavus, les deux espèces Eleotridae Eleotris spp. de Guyane, Evorthodus lyricus et Lophogobius cyprinoides (Pallas 1770). L'identification génétique des espèces des poissons et macrocrustacés capturés en Guadeloupe et en Guyane est vérifiée par analyse moléculaire (barcoding).