L’utilisation des peuplements de poissons pour mesurer la qualité des milieux aquatiques est ancienne. Ils possèdent plusieurs avantages :
- ils sont présents dans presque tous les milieux aquatiques ;
- leur taxonomie et leur écologie sont mieux connues que chez les autres groupes biologiques aquatiques
- ils occupent tous les niveaux trophiques et tous les habitats ;
- le grand public leur attribue une valeur esthétique et patrimoniale.
Ainsi, un programme de recherche « Qualité des Eaux de Surface » (QUES) mené par l’IRD et la DEAL a été engagé et a conduit à la consolidation d’un « indice poisson » en 2010, indice précédemment mis en œuvre par l’IRD. Cet indice permet d’évaluer la qualité des milieux en donnant une note aux stations de pêche. Des stations de référence ont ainsi été comparées à des stations perturbées afin de définir quelles sont les métriques importantes pour l’indice. Des notes allant de 1 à 5 sont attribuées aux stations à évaluer, 1 étant une station en très mauvais état et 5 une station en très bon état.
Cet indicateur nécessite encore quelques années d’utilisation pour le rendre plus robuste en l’enrichissant de nouveaux jeux de données