Il y a près de 500 espèces de poissons dans les cours d'eau guyanais mais leur répartition n'est pas homogène dans le territoire. L'indice poisson a été élaboré par comparaison entre la variabilité naturelle des peuplements dans des sites de référence et la situation dans des sites perturbés. Il est composé de 14 métriques décrivant la structure générale des peuplements (abondance, diversité, régularité) et sa composition taxonomique et trophique. Les résultats pour l'année 2009 font apparaitre une situation contrastée. Les bassins de l'Approuague, du Mahury et du haut Kourou présentent un bon état écologique alors que le bas Maroni, l'Oyapok et la Mana sont dans un état moyen. Il faut noter cependant qu'aucun station ne présente un très mauvais état et trois seulement un mauvais état. L'orpaillage dans la Mana et les activités agricoles autour de l'Acarouany sont probablement à l'origine de cette situation.